大黄素对K562细胞长链非编码RNA表达谱的影响
投稿时间:2017-08-30  修订日期:2017-09-04  点此下载全文
引用本文:郑利华,孙士鹏,程实,安成,侯雪筠,叶红蕾,庞博,刘贵建,吴志奎.大黄素对K562细胞长链非编码RNA表达谱的影响[J].医学研究杂志,2018,47(3):33-36,177
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2018.03.010
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作者单位E-mail
郑利华 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
孙士鹏 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院 sunshipeng@gamyy.cn 
程实 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
安成 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
侯雪筠 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
叶红蕾 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
庞博 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
刘贵建 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
吴志奎 100053 北京, 中国中医科学院广安门医院  
基金项目:国家重点基础研究发展计划"973"计划项目(2010CB530406);国家自然科学基金青年基金资助项目(81403192)
中文摘要:目的 研究大黄素作用K562细胞后长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的变化,筛选并验证差异lncRNA。方法 利用lncRNA芯片技术检测大黄素作用K562细胞后长链非编码RNA(lncRNA)表达谱,通过对原始数据进行处理,筛选出差异表达lncRNA并进行分析,挑选差异较大的4个lncRNA进行荧光定量PCR验证。结果 与DMSO对照组作用K562细胞后lncRNA表达谱相比,大黄素作用K562细胞后变化4倍以上lncRNA共11条。经过荧光定量PCR检测,大黄素作用K562细胞后CDR1AS和PROX1-AS1表达上调与芯片结果一致。结论 大黄素作用K562细胞后CDR1AS和PROX1-AS1等lncRNA表达的上调,为进一步深入研究大黄素抑制K562细胞增殖和促进K562细胞红细分化的分子机制打下基础。
中文关键词:大黄素  长链非编码RNA  CDR1AS  PROX1-AS1
 
Effect of Emodin on Long Non-coding RNA Expression of K562 Cell
Abstract:Objective To analyze the expression profile of long non-coding RNA (lncRNA) in K562 cells after treatment of Emodin. Methods The technique of lncRNA microarray was used to inspect the lncRNA expression profile in K562 cells after treatment of Emodin. The lncRNA was screened out and analyzed by analyzing the original data of lncRNA microarray. Four lncRNAs with large differences were selected for Real-time quantitative PCR analysis. Results 11 lncRNAs were in K562 cells of emodin group which had more than 4-fold variation than DMSO group. The expression of CDR1AS and PROX1-AS1 was up-regulated in K562 cells of emodin group by real-time quantitative PCR analysis. Conclusion Upregulation of CDR1AS and PROX1-AS1 in K562 cells induced by the emodin was the basis for further study of the molecular mechanism of inhibiting K562 cell proliferation and promoting K562 cells to erythropoiesis process.
keywords:Emodin  Long non-coding RNAs  CDR1AS  PROX1-AS1
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