ASPM基因在乳腺癌中的表达及临床意义
投稿时间:2019-10-14  修订日期:2019-10-25  点此下载全文
引用本文:吕珊妹,徐文杰,王艺臻,董学君.ASPM基因在乳腺癌中的表达及临床意义[J].医学研究杂志,2020,49(4):93-99
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2020.04.020
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作者单位E-mail
吕珊妹 温州医科大学检验医学院生命科学学院 312000  
徐文杰 绍兴市人民医院浙江大学绍兴医院 325035  
王艺臻 绍兴市人民医院浙江大学绍兴医院 325035  
董学君 温州医科大学检验医学院生命科学学院 312000 dxj9666@163.com 
基金项目:浙江省公益技术研究计划项目 (LGF18H200006);浙江省医药卫生研发培育项目 (2018TY073)
中文摘要:目的 研究有丝分裂相关基因ASPM(abnormal spindle microtubule assembly)在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨ASPM作用机制。方法 利用Oncomine数据库检测ASPM在乳腺癌组织中的表达情况,采用GSE3494数据集和Kaplan-Meier在线分析ASPM表达与乳腺癌患者的预后关系,并结合TCGA数据库分析ASPM表达与临床病理指标的相关性。利用GSE3494数据集进行基因富集分析 (GSEA)预测ASPM相关通路。利用String数据库分析与ASPM相关的蛋白并通过TIMER数据库验证。利用RT-qPCR验证在13对乳腺癌组织与配对的癌旁组织中ASPM的表达情况。结果 与正常乳腺组织比较,ASPM在乳腺癌组织中高表达,且高表达组具有较短的总生存期 (HR=1.71, P=0.000)。GSE3494和TCGA数据库分析发现ASPM表达与ER、PR水平显著相关(P=0.000),TCGA数据库分析结果显示ASPM表达还跟年龄 (P=0.002)以及TNM分期中的T分期 (P=0.000)和N分期 (P=0.030)显著相关。ASPM高表达样本主要富集在细胞周期、氧化磷酸化、DNA修复、错配修复、剪接体和蛋白酶体等基因集 (P<0.01),结合String以及TIMER的结果,ASPM可能与BUB1、CCNA2、TTK、CDC20、CDK1相互结合作用,促进乳腺癌的发生、发展。RT-qPCR结果显示,ASPM在乳腺癌组织中表达上调。结论 ASPM基因在乳腺癌组织中高度表达,并与临床病理指标相关,可作为预测乳腺癌预后的标志物进一步研究。
中文关键词:乳腺癌 ASPM GEO数据库 TCGA数据库
 
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