| lncRNA MRAK048635_P1对血管平滑肌细胞miRNA的调控作用 |
| 投稿时间：2019-09-05 修订日期：2019-10-29 点此下载全文 |
| 引用本文：方根强,祁佳,黄黎亚,赵仙先,陈书艳.lncRNA MRAK048635_P1对血管平滑肌细胞miRNA的调控作用[J].医学研究杂志,2020,49(5):58-64 |
| DOI：
10.11969/j.issn.1673-548X.2020.05.013 |
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| 基金项目:国家自然科学基金资助项目(81570208) |
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| 中文摘要:目的 旨在预测VSMC细胞中MRAK048635_P1参与调控的miRNAs并对其靶基因进行系统的生物学分析。方法 利用特异性siRNA敲减来自正常大鼠胸主动脉VSMC中的MRAK048635_P1基因。整体层次聚类分析用于判断各组中差异表达的miRNAs。应用miRanda、PITA和RNAhybrid预测差异表达的miRNAs的靶基因并取其交集作为分析的基因集合,分别进行gene ontology (GO)中的细胞组分 (cellular component, CC)、分子功能 (molecular function, MF)和生物学过程(biological process,BP)分析。最后,对差异表达的miRNAs的靶基因进行kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG)生物通路富集分析。结果 siRNA介导VSMC细胞MRAK048635_P1下调后,共有12个差异表达的miRNAs,其中上调和下调的miRNAs个数分别为5和7。差异表达的miRNAs的靶基因共5066个。GO富集分析发现其中的302个基因主要富集于VSMC分化 (如G protein-coupled estrogen receptor 1,Gper1),血管内皮迁移的负调控、心血管系统发育、信号受体活性、核染色质和蛋白结合以及免疫应答等。KEGG富集发现这些靶基因显著富集于轴突导向、昼夜节律、N-糖基生物合成、内吞蛋白加工、内质网矿物吸收、鞘脂代谢和核糖体生物合成等相关通路 (P＜0.05)。结论 在VSMC中,MRAK048635_P1可能通过与多种miRNAs相互作用而参与相关靶基因的调控,对于MRAK048635_P1的深入研究有助于揭示VSMC在高血压病中的作用机制。 |
| 中文关键词:lncRNA MRAK048635_P1 miRNAs 靶基因 VSMC 生物信息学 |
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