miR-182作为胃癌潜在生物学标志物的 Meta分析及生物信息学分析
投稿时间:2019-12-05  修订日期:2019-12-05  点此下载全文
引用本文:徐雪莲,唐富天,张凡,曾蕾,罗曼曼,李玉民.miR-182作为胃癌潜在生物学标志物的 Meta分析及生物信息学分析[J].医学研究杂志,2020,49(7):54-61,43
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2020.07.013
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徐雪莲 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000  
唐富天 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000  
张凡 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000  
曾蕾 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000  
罗曼曼 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000  
李玉民 兰州大学第二医院、甘肃省消化系统肿瘤重点实验室 730000 liym@lzu.edu.cn 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31770537);国家国际科技合作专项基金资助项目(2015DFA31650)
中文摘要:目的 研究miR-182在胃癌中的表达,分析其作为胃癌生物学标志物的诊断价值及相关的分子机制。方法 从GEO、TCGA及数据库获取miR-182的表达数据,使用Stata14.0软件分别对胃癌患者组织和血液/血清中miR-182的表达进行Meta分析和诊断性Meta分析。运用5个预测数据库预测miR-182的靶基因,通过GO、KEGG富集分析及蛋白质相互作用(PPI)网络分析探索miR-182在胃癌中的生物学功能和关键基因(Hub基因)。结果 共纳入20个研究,包括13个胃癌组织研究和7个血液/血清研究。通过随机效应模型(SMD=1.09,95%CI:0.26~1.92)发现miR-182在胃癌组织中显著增加(I2=96.3%, P=0.000)。此外,SROC曲线下面积、特异性和敏感度分别为0.76、0.75和0.65。在胃癌患者的血液/血清中,miR-182同样显著上调(SMD=3.37,95%CI:2.15~4.59,I2=97.8%,P=0.000)。SROC曲线下面积、特异性和敏感度分别为0.90、0.72和0.90。GO和KEGG富集分析表明,miR-182的靶基因与多种重要通路有关。最后,通过PPI分析筛选出4个Hub基因(NRAS、CREB1、FBXW7和SOX2)。结论 miR-182在胃癌样本中上调,可能通过靶向其靶基因在胃癌中发挥重要作用,其可能是胃癌诊断的潜在生物学标志物。
中文关键词:生物学标志物 胃癌 miRNA-182 Meta分析 生物信息学分析
 
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