miRNA-210-3p在大肠癌细胞迁移侵袭中的促进作用及其靶基因的生物信息学分析
投稿时间:2020-03-18  修订日期:2020-03-26  点此下载全文
引用本文:潘鑫,李婉明,于敏,方瑾.miRNA-210-3p在大肠癌细胞迁移侵袭中的促进作用及其靶基因的生物信息学分析[J].医学研究杂志,2020,49(9):51-56
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2020.09.012
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作者单位E-mail
潘鑫 中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、生命科学院细胞生物学教研室沈阳 110122  
李婉明 中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、生命科学院细胞生物学教研室沈阳 110122  
于敏 中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、生命科学院细胞生物学教研室沈阳 110122  
方瑾 中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、生命科学院细胞生物学教研室沈阳 110122 jfang@cmu.edu.cn 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81672920,81502703);辽宁省沈阳市中青年科技创新人才支持计划项目(BC190261)
中文摘要:目的 探讨miR-210-3p在大肠癌细胞迁移、侵袭中的作用,并利用生物信息学方法预测其靶基因及信号通路。方法 采用dbDEMC和OncomiR数据库分析miR-210-3p在大肠癌中的表达情况,通过荧光定量PCR法验证miR-210-3p在大肠癌细胞系中的表达;通过转染miRNA 模拟物、抑制剂上调和下调大肠癌细胞内miR-210-3p的表达量,Transwell法检测转染后大肠癌细胞的迁移和侵袭能力变化;通过miRDB、TargetScan7.2、starBase和miRPathDB数据库预测miR-210-3p靶基因,利用DAVID数据库进行GO分析及信号通路的富集分析,利用GEPIA数据库分析关键基因在大肠癌组织中的表达。结果dbDEMC和OncomiR数据库显示miR-210-3p在大肠癌组织中高表达,并与肿瘤转移和患者预后相关。荧光定量PCR验证miR-210-3p在高转移性结肠癌细胞系HCT-116、LoVo中的表达量高于中转移性细胞系SW480和低转移性细胞系CL187、HCT-8。过表达miR-210-3p能明显增强SW480细胞迁移和侵袭能力;下调miR-210-3p的表达后,LoVo细胞迁移和侵袭能力则明显减弱。共预测出3035个靶基因,其功能主要富集在细胞迁移、黏附、蛋白质代谢等生物学过程以及癌症通路、HIF、Rap1等信号转导通路,GEPIA数据库验证显示RGMA在临床大肠癌组织中呈显著低表达,可能是miR-210-3p的靶基因。结论 miR-210-3p可促进大肠癌细胞迁移和侵袭能力,有望成为大肠癌治疗的新型生物靶点。
中文关键词:miR-210-3p 大肠癌 侵袭 生物信息学 靶基因
 
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