基于生物信息学分析筛选肾上腺皮质癌核心基因
投稿时间:2020-04-13  修订日期:2020-04-18  点此下载全文
引用本文:张德莲,蔡昕添,洪静,朱晴,吴婷,李南方.基于生物信息学分析筛选肾上腺皮质癌核心基因[J].医学研究杂志,2020,49(9):62-66
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2020.09.014
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张德莲 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001  
蔡昕添 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001  
洪静 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001  
朱晴 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001  
吴婷 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001  
李南方 新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心、新疆高血压研究所、国家卫生健康委员会高血压诊疗研究重点实验室乌鲁木齐 830001 lnanfang2016@sina.com 
基金项目:中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目(2019PT330003)
中文摘要:目的 通过生物信息学方法研究肾上腺皮质癌发生、恶化的核心基因,探索可能的预后评估、筛选诊断的分子生物学标志物,为肾上腺皮质癌潜在治疗靶点提供了生物信息学证据支持。方法 从GEO数据库下载GSE14922、GSE19750和GSE90713芯片数据,利用一系列生物信息学方法对GSE14922芯片进行处理、分析并筛选差异基因。再通过CytoHuhha插件筛选出核心基因,最后分别利用在线分析工具GEPIA和GSE19750、GSE90713芯片数据对核心基因进行生存分析与诊断试验分析。结果 从GSE14922芯片获得90个差异基因。通过CytoHuhha插件获得了6个核心基因分别为BUB1、CDK1、CENPF、NDC80、ASPM和DLGAP5。Kaplan-Meier生存曲线分析的结果表明上述核心基因对肾上腺皮质癌患者的诊断及生存预后具有显著影响。ROC分析的结果表明上述核心基因对肾上腺皮质癌患者具有较好的诊断意义。结论 通过生物信息学分析获得6个核心基因在肾上腺皮质癌的发生、进展中发挥重要作用,并为揭示肾上腺皮质癌潜在的诊断、预后标志物和治疗靶点提供了新的理论依据。
中文关键词:肾上腺皮质癌 核心基因 生物学标志物 生物信息学
 
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