肝细胞内质网应激对tsRNA表达谱的影响及其功能研究
投稿时间:2020-07-29  修订日期:2020-08-03  点此下载全文
引用本文:李涵,潘勤.肝细胞内质网应激对tsRNA表达谱的影响及其功能研究[J].医学研究杂志,2021,50(1):27-32
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2021.01.007
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李涵 上海交通大学医学院附属新华医院消化内科 200092  
潘勤 上海交通大学医学院附属新华医院消化内科 200092 panqin@xinhuamed.com.cn 
基金项目:国家重点研发计划项目精准医学研究专项基金资助项目(2017YFC0908903);国家自然科学基金资助项目(81270492,81470859)
中文摘要:目的 探讨肝细胞内质网应激相关的tRNA 衍生性小RNA(tRNA derived small RNA, tsRNA)表达谱及其功能特征。方法 将AML12细胞随机分为对照组和高脂组,采用棕榈酸刺激高脂组,建立肝细胞内质网应激模型。以RT-qPCR和Western blot法检测内质网应激标志蛋白GRP78和CHOP的表达,油红O染色法观察脂滴生成情况。通过高通量测序技术检测tsRNA表达谱并筛选出差异基因。利用生物信息学分析预测差异tsRNA的靶基因,并通过GO分析和KEGG分析研究差异tsRNA的潜在功能。结果 与对照组比较,棕榈酸干预导致高脂组GRP78和CHOP 表达在mRNA及蛋白水平均显著升高(P<0.05),脂肪变性显著加重。tsRNA测序得到38条差异tsRNA(倍数变化> 2,P<0.05)。GO分析显示,差异tsRNA的靶基因主要调控类黄酮代谢、葡萄糖醛酸代谢和岩藻糖基化等功能。KEGG分析显示,差异tsRNA的靶基因在戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、淀粉和蔗糖代谢、cAMP及Rap1等肝细胞代谢相关的信号通路中高度富集。结论 内质网应激可显著改变肝细胞的tsRNA表达谱,其功能可能与调控肝脏糖代谢及生物转化作用有关。
中文关键词:tsRNA 内质网应激 肝细胞 生物信息学
 
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