| 肝细胞癌相关差异表达基因和药物预测的生物信息学分析 |
| 投稿时间：2020-09-19 修订日期：2020-09-23 点此下载全文 |
| 引用本文：张依,张玉峰,牛文辉,戚亚婷,赵永华,樊亚芳.肝细胞癌相关差异表达基因和药物预测的生物信息学分析[J].医学研究杂志,2021,50(2):63-68 |
| DOI：
10.11969/j.issn.1673-548X.2021.02.015 |
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| 基金项目:河南省科技攻关项目(192102310428) |
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| 中文摘要:目的 通过生物信息学方法筛选肝细胞癌(HCC)相关差异表达基因(DEGs)及潜在治疗药物。方法 从GEO数据库中选取GSE45436、GSE84402、GSE62232和GSE101685,使用R软件分析得到DEGs。随后对DEGs进行GO和KEGG分析,并构建PPI网络、筛选核心基因。最后进行生存分析和筛选潜在治疗药物。结果 共获得496个DEGs,主要调控细胞分裂、有丝分裂等生物学过程,主要参与代谢和细胞周期等通路。PPI分析筛选出10个显著高表达的核心基因,包括MAD2L1、BUB1B、NCAPG、CCNA2、CCNB2、KIF11、CDK1、TTK、BUB1、CCNB1。生存分析发现核心基因高表达组生存率均低于低表达组生存率。并且槲皮苷、白藜芦醇、姜黄素、雷公藤甲素、相思子碱可降低核心基因的表达水平。结论 通过研究HCC相关DEGs和潜在治疗药物,探讨HCC的潜在分子机制,为临床和实验研究提供基础。 |
| 中文关键词:肝细胞癌 生物信息学 差异表达基因 核心基因 |
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