| 中文摘要:目的 使用生物信息学方法分析骨性关节炎滑膜组织差异表达基因,并探索潜在诊断和治疗靶点。方法 从GEO数据库下载GSE55235、GSE55457、GSE55584,整合3个数据集使用在线工具Network-Analyst筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),使用R软件分析DEGs基因本体论和KEGG信号通路,通过STRING、Cyto-scape工具构建PPI调控网络、筛选核心基因,再使用R软件绘制受试者工作特征曲线。结果 得到327个DEGs主要参与含胶原的细胞外基质、转录因子复合物的组成；白细胞迁移、皮质类固醇反应等生物过程；发挥信号蛋白受体激活、细胞因子激活、趋化因子激活等分子功能；富集于破骨细胞分化,轴突引导、IL-17、TNF等KEGG信号通路。5个核心基因TLR7、TLR3表达上调,CXCL8、IL-6、VEGFA表达下调,且受试者工作特征曲线下面积(area under curve, AUC)均＞0.7。结论 5个核心基因可能是OA滑膜标志物,同时DEGs参与的生物学功能和信号通路可能为OA分子机制研究提供生物信息学依据。 |
