基于TNF家族基因的肝癌分型及预后模型的建立
投稿时间:2022-03-04  修订日期:2022-03-19  点此下载全文
引用本文:吴白骏,刘恬,胡朝全.基于TNF家族基因的肝癌分型及预后模型的建立[J].医学研究杂志,2022,51(12):44-51
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2022.12.010
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作者单位
吴白骏 贵州医科大学贵阳 550004 
刘恬 西南医科大学附属医院肿瘤科 泸州 646000 
胡朝全 贵州医科大学贵阳 550004 
基金项目:贵州省科技计划项目{黔科合基础[2020]1Y336}
中文摘要:目的 为了能够识别获益于免疫治疗的肝癌患者及评估预后,亟需建立肝癌新分型与预后模型。方法 应用无监督聚类方法对TCGA-LIHC数据集中的肝癌样本进行分型, ssGSEA算法评估免疫细胞浸润能力,TIDE评分评估免疫治疗反应能力,应用COX与LASSO回归分析方法构建基于TCGA-LIHC数据集的风险评分模型,并在ICGC-LIRI-JP数据集中验证模型的准确性。结果 基于TNF家族基因的表达水平可以将肝癌患者分为TNF-A型与TNF-B型,分析发现TNF-A型预后好,免疫细胞浸润程度高,肿瘤突变负荷小,免疫逃逸能力弱以及对免疫治疗反应较好。利用两型的差异基因笔者构建了风险评分模型,其中模型的1年、3年和4年总生存期的曲线下面积(area under the curve, AUC)分别为0.758、0.789和0.768,验证集分别为0.674、0.713和0.710,证明预后模型具有较高的准确度,且高风险组患者预后差,具有较高的T分期及TNM分期。结论基于TNF家族基因建立的肝癌新分型用来评估患者对免疫治疗的反应,并构建风险评分模型以预测肝癌患者的预后。
中文关键词:肝细胞癌 免疫治疗 预后模型 分子分型 肿瘤坏死因子
 
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