宏基因组二代测序在社区获得性肺炎中的应用价值
投稿时间:2022-05-05  修订日期:2022-05-27  点此下载全文
引用本文:张娟娟,闫晓培,李宁.宏基因组二代测序在社区获得性肺炎中的应用价值[J].医学研究杂志,2022,51(12):96-99
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2022.12.020
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作者单位
张娟娟 南京医科大学附属苏州医院 215002 
闫晓培 南京医科大学附属苏州医院 215002 
李宁 南京医科大学附属苏州医院 215002 
基金项目:江苏省苏州市“科教兴卫”青年科技项目(KJXW2019027)
中文摘要:目的 探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)检测支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)中病原微生物在社区获得性肺炎中的诊断价值。方法 选取2018年11月~2021年7月至苏州市立医院住院的初始治疗失败的社区获得性肺炎患者57例,所得BALF同时进行传统方法和mNGS检测,比较两种方法的诊断价值。结果 在57例患者BALF病原学检测中,mNGS的检出率高于传统方法(80.70% vs 33.33%),差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS检测的采信率为84.78%,敏感度为90.70%,特异性为50.00%,阳性预测值为84.78%,阴性预测值为63.64%。mNGS检测细菌阳性率高于传统方法(43.86% vs 15.79%),差异有统计学意义(P<0.05),但两者检测真菌、结核及病毒的阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS联合传统方法检测后,75.44%(43/57)患者确诊,43.86%(25/57)患者根据mNGS检测结果调整了治疗方案。结论 在初治失败的社区获得性肺炎BALF病原学检测中,mNGS的检出率高于传统方法,尤其是对于细菌感染的诊断价值更高,可早期识别病原体,有效指导诊治。
中文关键词:宏基因组二代测序技术 肺泡灌洗液 社区获得性肺炎 病原体
 
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