狼疮肾炎肾小球中细胞焦亡的生物信息学分析及验证
投稿时间:2022-05-29  修订日期:2022-06-05  点此下载全文
引用本文:彭璇,付荣.狼疮肾炎肾小球中细胞焦亡的生物信息学分析及验证[J].医学研究杂志,2023,52(5):62-67
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2023.05.014
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作者单位
彭璇 广州医科大学附属第二医院 510260 
付荣 广州医科大学附属第二医院 510260 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81801614);广东省基础与应用基础研究基金资助项目(2021A1515011007)
中文摘要:目的 利用生物信息学分析狼疮肾炎(lupus nephritis, LN)与正常对照(NC)肾活检组织肾小球的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及细胞焦亡相关基因、免疫细胞浸润情况,为LN发病机制的认识、药物开发等提供新的思路。方法 分析转录组数据集GSE32591筛选出LN和NC组的DEGs并与细胞焦亡相关基因取交集得到细胞焦亡相关DEGs,进行GO、KEGG功能富集、核心基因识别及验证等,明确细胞焦亡相关DEGs主要参与的信号通路,并利用CIBERSORT分析22种免疫细胞浸润情况明确LN的免疫状态。结果 筛选出12个细胞焦亡相关DEGs,主要位于细胞膜和炎性小体,参与细胞因子分泌、细胞因子产生的正调控、MyD88依赖性Toll样受体信号通路等。免疫浸润分析提示初始B细胞(P=0.043)、单核细胞(P=0.025)LN表达升高,而记忆B细胞(P=0.002)、静息CD4+T记忆细胞(P=0.011)、滤泡辅助T细胞(P=0.007)和静息NK细胞(P=0.046)LN表达降低。发现前3位Hub基因CASP1、TLR2和MYD88表达在LN肾组织中明显升高,并与LN肾小球中记忆B细胞、静息CD4+T记忆细胞和静息NK细胞呈负相关,与单核细胞呈正相关。结论 CASP1、TLR2和MYD88可能通过免疫细胞浸润影响LN的疾病进展,可能是预测肾小球细胞浸润的重要生物学标志物,为LN治疗提供新的思路。
中文关键词:狼疮肾炎 细胞焦亡 免疫细胞浸润 生物信息学分析
 
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