生物信息学分析CHD3在卵巢癌中的作用
投稿时间:2022-10-09  修订日期:2022-10-30  点此下载全文
引用本文:黄姗,农敏玉,王梦灵,蒋利和.生物信息学分析CHD3在卵巢癌中的作用[J].医学研究杂志,2023,52(10):100-106
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2023.10.020
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作者单位
黄姗 右江民族医学院临床医学院百色 533000 
农敏玉 右江民族医学院临床医学院百色 533000 
王梦灵 右江民族医学院临床医学院百色 533000 
蒋利和 右江民族医学院临床医学院百色 533000
遵义医科大学贵州省基因检测与治疗特色重点实验室,遵义 563000 
基金项目:贵州省基因检测与治疗特色重点实验室开放课题(00702);2021年广西壮族自治区区级大学生创新创业训练计划项目(S202110599066)
中文摘要:目的 本研究利用生物信息学分析CHD3基因在卵巢癌中的临床作用,探究卵巢癌的潜在肿瘤标志物。方法 通过Oncomine数据库检测健康卵巢样品和卵巢癌组织中CHD基因家族的mRNA表达,Kaplan-Meier plotter评估了卵巢癌患者的CHD3的预后值,并利用多种工具分析了与CHD3相关的临床作用,如突变、卵巢癌的临床分期、免疫亚型、药物敏感度和m6A相关基因等。利用R软件对CHD3的GSEA基因富集分析进行了分析。结果 卵巢癌患者的CHD3mRNA表达水平显著上调,且高表达CHD3mRNA水平在卵巢癌患者中显示出较好的总生存期和无进展生存期。此外,CHD3的表达水平在免疫亚型等方面比较,差异有统计学意义。CHD3与具有甲基转移酶(METL16、RBM15B)和RNA结合蛋白(YTHDC1)的调节相关基因呈显著正相关,CHD3的表达可考虑确定NSC319726化疗药物在卵巢癌患者中的治疗效果。最后,CHD3可能涉及通过Notch信号通路影响卵巢癌的发展。结论 CHD3基因可能是诊断卵巢癌和影响预后的肿瘤标志物。
中文关键词:CHD3基因 卵巢癌 生物信息学
 
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