基于生物信息学筛选分析脓毒症预后相关核心基因
投稿时间:2022-11-20  修订日期:2022-12-31  点此下载全文
引用本文:汪茜,龚睿,龙刚宇,黄朝林,张定宇.基于生物信息学筛选分析脓毒症预后相关核心基因[J].医学研究杂志,2024,53(1):24-30
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2024.01.007
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作者单位
汪茜 华中科技大学同济医学院附属武汉金银潭医院重症医学科 430023 
龚睿 中国科学技术大学生命科学与医学部第一附属医院重症医学科,合肥 230001 
龙刚宇 华中科技大学同济医学院附属武汉金银潭医院重症医学科 430023 
黄朝林 华中科技大学同济医学院附属武汉金银潭医院重症医学科 430023 
张定宇 华中科技大学同济医学院附属武汉金银潭医院重症医学科 430023 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(92169107)
中文摘要:目的 基于生物信息学分析影响脓毒症预后的潜在核心基因。方法 利用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选到脓毒症患者的基因表达数据集GSE54514和GSE65682,通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和维恩分析筛选与脓毒症预后相关的关键基因,采用Metascape数据库、RcisTarget包和CIBERSORT算法进行基因功能富集分析、转录因子富集分析及免疫浸润分析。选取数据集GSE5772进行验证,筛选与脓毒症预后相关的核心基因并使用Kaplan-Meier法进行生存分析。结果 对数据集GSE54514、GSE65682分别进行WGCNA分析,筛选出与脓毒症预后相关性最高的“绿色”和“棕色”模块,并对两个模块的基因取交集,维恩分析得到20个关键基因。这些关键基因主要富集在细胞形态调节、单核细胞迁移等通路上。转录因子富集分析显示转录因子ZNF148可能是基因集的主要调控因子之一。进一步通过数据集GSE5772验证,发现基因FGD3、MBP、MSN、RNF130和SETD1B在脓毒症患者中明显低表达(P<0.05)。免疫浸润分析表明这5个核心基因均与免疫细胞含量密切相关,其中只有FGD3、MSN和RNF130的表达与脓毒症患者的生存率相关(P<0.05)。结论 基于生物信息学分析筛选到与脓毒症预后相关的5个核心基因,这些基因与免疫细胞密切相关,其中基因FGD3、MSN和RNF130可能是脓毒症预后的重要预测因子。
中文关键词:脓毒症 预后 生物信息学 加权基因共表达网络分析
 
Analysis of Satisfaction and Service Effectiveness of Telemedicine from the Perspective of Medical Staff
Abstract:Purpose/Significance To analyze the satisfaction, service effectiveness and willingness to participate in telemedicine services from the perspective of medical staff, and to identify the existing problems. Method/Process The research group conducts an electronic questionnaire survey for medical institutions across the country, and collects a total of 1 524 valid questionnaires. Based on questionnaire survey data, logistic regression models are constructed to analyze the key factors that affect the evaluation and attitude of medical staff. Result/Conclusion The overall satisfaction and service effectiveness of medical staff to telemedicine services are at a high level, and their willingness to participate is strong. It is necessary to improve the telemedicine service system and promote the experience of medical staff by strengthening infrastructure construction, optimizing service process, and perfecting incentive mechanisms.
keywords:telemedicine  medical staff  satisfaction  service effectiveness
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