| 基于生物信息学方法分析R-spondin3在乳腺癌中的表达及其预后价值 |
| 投稿时间：2022-10-29 修订日期：2022-11-02 点此下载全文 |
| 引用本文：蒋树云,张英,马德寿,赵元红,马志军.基于生物信息学方法分析R-spondin3在乳腺癌中的表达及其预后价值[J].医学研究杂志,2023,52(12):54-60 |
| DOI：
10.11969/j.issn.1673-548X.2023.12.013 |
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| 基金项目:国家自然科学基金地区基金资助项目(82060485)；青海省科技厅应用基础研究基金资助项目(2019-ZJ-7091) |
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| 中文摘要:目的 探讨R-spondin3(RSPO3)在乳腺癌中的表达及预后价值。方法 应用TIMER、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)、基因表达谱数据动态分析(gene expression profilling in-teractive analysis 2, GEPIA2)、人类蛋白质表达图谱(Human Protein Atlas, HPA)等数据库分析RSPO3在乳腺癌组织和癌周正常组织中的差异表达,并分析其表达水平与乳腺癌病理学参数之间的相关性；GEPIA2数据库探讨RSPO3转录本在乳腺癌中的表达及其结构特征；Kaplan-Meier Plotter绘制RSPO3与乳腺癌患者的预后生存曲线；运用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等对其进行基因功能富集分析和代谢通路分析；应用TIMER数据库分析RSPO3的表达水平与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的相关性。结果 RSPO3在乳腺癌中呈低表达,且其表达水平与乳腺癌患者的年龄、肿瘤最大径、分子分型相关,在乳腺癌中低表达的RSPO3与患者的预后不良相关；GO功能富集分析显示,RSPO3相互作用的基因主要富集于免疫细胞及其受体等参与的生物学过程；免疫细胞浸润分析结果显示,RSPO3在乳腺癌组织中的表达水平与CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、CD4+记忆T细胞、巨噬细胞、B细胞等的浸润水平呈正相关,而与调节性T细胞(Treg细胞)的浸润水平呈负相关；KEGG代谢通路分析显示,RSPO3可能参与Wnt/β-catenin通路。结论 在乳腺癌中低表达的RSPO3与患者的不良预后相关,其可能通过抑制免疫细胞浸润及活化Wnt/β-catenin通路参与乳腺癌的进展。 |
| 中文关键词:乳腺癌 R-spondin3 生物信息学 表达 预后 |
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