| 中文摘要:目的 通过多重生物信息学筛选慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure, ACLF)关键基因及通路,为ACLF分子生物学研究和生物学标志物筛选提供理论依据。方法 首先从基因表达数据集(Gene Expression Omnibus, GEO)下载ACLF转录组mRNA微阵列数据集,利用R软件中limma包进行基因表达量差异分析,并通过David数据库对差异基因进行基因本体论(gene ontology, GO) 功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)分析；利用STRING数据库绘制蛋白质互作(protein-protein interaction, PPI)网络图,Cytoscape软件筛选关键差异基因。结果 共筛选得到329个差异表达基因,其中上调基因185个,下调基因144个。GO功能富集分析得到条目385个,包含免疫受体活性、细胞因子受体活性、T细胞受体结合等生物学功能(P<0.05)；KEGG通路富集分析筛选到36条信号通路,免疫和炎症相关的通路包括Th1和Th2细胞分化、Th17细胞分化通路、T细胞受体信号通路、原发性免疫缺陷、NF-κB信号通路和TNF信号通路等。进一步得到与ACLF相关的核心差异基因CD3G、CD3D、IL7R、LCK、IL1R2、IL18R1、IL1R1和MAPK14,这些基因可能成为ACLF潜在的生物标志物及治疗靶点。结论 本研究发现,CD3G、CD3D、IL7R、LCK、IL1R2、IL18R1、IL1R1和MAPK14可能成为ACLF发生、发展相关核心基因和未来新的治疗靶点。 |
