| 基于铁死亡相关基因构建结直肠癌预后风险模型 |
| 投稿时间：2023-06-18 修订日期：2023-08-25 点此下载全文 |
| 引用本文：陈林,贾彦彦,张丽静.基于铁死亡相关基因构建结直肠癌预后风险模型[J].医学研究杂志,2024,53(7):45-50, 56 |
| DOI：
10.11969/j.issn.1673-548X.2024.07.010 |
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| 基金项目:国家自然科学基金青年科学基金资助项目(81902466) |
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| 中文摘要:目的 基于铁死亡相关基因构建预测能力较好的结直肠癌(colorectal cancer, CRC)预后风险模型。方法 从UCSC Xena及FerrDb V2数据库获得CRC患者的转录水平、临床数据及最新铁死亡相关基因。利用R语言和单因素COX回归分析筛选出与预后有关的基因,通过LASSO回归结合多因素COX回归分析确立最终的预后风险模型。然后采用R语言“survival”包、“timeROC”包及COX回归对模型进行生存分析及预测能力评估。结果 筛选出由NEDD4L、TIMP1、KIF20A、GDF15、ENO3、TERT、MS4A15、HOTAIR 8个铁死亡相关差异基因构建的预后模型。模型将纳入的CRC患者分为两组,两组间的生存预后差异有统计学意义(P<0.05)。受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果显示,1、3、5年曲线下面积分别为0.732、0.702、0.738。GO和KEGG分析结果显示,两组间基因在肿瘤进程、炎性反应甚至免疫等功能及通路中富集。免疫相关功能、免疫细胞浸润及免疫检查点在高低风险组之间比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 基于8个铁死亡相关差异基因构建的预后模型对CRC有独立的预后作用,对CRC的预后预测提供了新的思路。 |
| 中文关键词:结直肠癌 生物信息学 铁死亡 预后 |
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