| 长链非编码RNA PURPL调控miRNA/mRNA 网络的生物信息学分析 |
| 投稿时间：2023-08-20 修订日期：2023-09-05 点此下载全文 |
| 引用本文：郭雪莹,张瑞涛,何婷婷,赵丽敏,冯巍,任淑敏.长链非编码RNA PURPL调控miRNA/mRNA 网络的生物信息学分析[J].医学研究杂志,2024,53(7):129-135, 140 |
| DOI：
10.11969/j.issn.1673-548X.2024.07.026 |
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| 基金项目:国家卫生健康委员会科学研究基金-河南省医学科技攻关计划省部共建项目重点项目(SBGJ202102112) |
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| 中文摘要:目的 充分挖掘生物信息学数据库,筛选可与长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)PURPL结合的微小RNA(microRNA,miRNA)及下游靶基因和信号通路,进而构建PURPL/miRNA/靶基因/信号通路调控网络,为后续研究PURPL参与卵巢癌细胞侵袭和转移的分子机制奠定基础。方法 基于lncRNA/miRNA调控机制,多数据库交叉预测可与PURPL结合的下游miRNA及其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作网络分析和核心蛋白筛选,进而行基因本体(gene ontology,GO)、疾病和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。结果 PURPL在正常组织和癌组织(包括正常卵巢组织和卵巢癌组织)中存在差异化表达,筛选出3个下游miRNA及其341个靶基因,经过蛋白质互作网络分析、富集分析,筛选出15个核心基因,最终确定了PURPL、下游3个miRNA、15个核心靶基因及潜在信号通路组成的调控网络。结论 PURPL/miRNA/靶基因/信号通路调控网络可为后续卵巢癌侵袭和转移的分子机制研究提供潜在的分子靶点。 |
| 中文关键词:生物信息学 卵巢癌 非编码RNA PURPL |
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