基于铁死亡相关基因构建头颈部鳞状细胞癌的预后预测模型并验证
投稿时间:2022-05-13  修订日期:2022-05-23  点此下载全文
引用本文:贺晴,曹晓林,韩弈垣,刘翰林.基于铁死亡相关基因构建头颈部鳞状细胞癌的预后预测模型并验证[J].医学研究杂志,2023,52(4):64-68
DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2023.04.016
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作者单位
贺晴 浙江中医药大学第四临床医学院 杭州,310053 
曹晓林 浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院耳鼻咽喉头颈外科 310006 
韩弈垣 浙江中医药大学第四临床医学院 杭州,310053 
刘翰林 浙江中医药大学第四临床医学院 杭州,310053 
基金项目:浙江省医药卫生科技计划项目(2015KYB284)
中文摘要:目的 构建基于铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes, FRGs)的头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)预后预测模型并验证。方法 从TCGA和GEO数据库下载HNSCC RNA-seq数据及相关临床数据,分别作为训练队列和验证队列。从FerrDb网站提取共259个FRGs。利用单因素COX回归分析在训练队列中筛选与HNSCC患者预后有关的FRGs(P<0.01)。利用Lasso COX回归分析构建预后预测模型,并根据风险评分公式计算各临床样本的风险系数,然后使用Kaplan-Meier生存曲线和时间依赖性受试者操作特征(time-dependent receiver operating characteristic, time ROC)曲线评估该模型效能。同理,验证该模型在验证队列中的可行性和可重复性。最后采用单因素及多因素COX回归分析对该预后预测模型进行独立预后分析。结果 训练队列中与HNSCC患者预后显著相关的FRGs共有12个,在此基础之上利用Lasso COX回归算法构建了11个FRGs构成的预后预测模型。Kaplan-Meier生存曲线分析显示,高风险组的总生存率明显低于低风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。time ROC曲线分析显示,该模型预测第1、3、5年总生存的曲线下面积(area under the curve, AUC)分别为0.649、0.729、0.688。独立预后分析显示,该评分模型可作为预测HNSCC的独立预后因素(P<0.001)。该模型在验证队列中得到了进一步验证。结论 本研究构建了11个FRGs的预后预测模型,且可作为HNSCC患者的独立预后因素。
中文关键词:头颈部鳞状细胞癌 铁死亡相关基因 TCGA GEO 预后模型
 
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